Table 2 Allele and genotype frequency of the SNPs

MCI

293

342(58.4)

244(41.6)

97(33.1)

148(50.5)

48(16.4)

0.50

HC

276

292(52.9)

260(47.1)

81(29.3)

130(47.1)

65(23.6)

0.36

BIN1

rs7561528

A

G

6.39

0.01^b

A

AA

AG

GG

6.79

0.03^b

MCI

303

58(9.6)

548(90.4)

5(1.7)

48(15.8)

250(82.5)

0.14

HC

301

86(14.3)

516(85.7)

7(2.3)

72(23.9)

222(73.8)

0.69

RIN3

rs10498633

G

T

0.88

0.35

T

GG

GT

TT

4.64

0.10

MCI

309

543(87.9)

75(12.1)

238(77.0)

67(21.7)

4(1.3)

0.77

HC

311

557(89.5)

65(10.5)

254(81.7)

49(15.8)

8(2.6)

0.01

PICALM

rs10792832

A

G

0.36

0.55

A

AA

AG

GG

0.93

0.63

MCI

307

248(40.4)

366(59.6)

45(14.7)

158(51.5)

104(33.9)

0.23

HC

309

260(42.1)

358(57.9)

54(17.5)

152(49.2)

103(33.3)

0.87

SPI1

rs1057233

C

T

0.89

0.35

C

CC

TC

TT

0.92

0.63

MCI

251

155(30.9)

347(69.1)

25(10.0)

105(41.8)

121(48.2)

0.75

HC

285

161(28.2)

409(71.8)

25(8.8)

111(38.9)

149(52.3)

0.51

TMP21

rs12435391

A

G

1.18

0.28

A

AA

AG

GG

1.77

0.41

MCI

308

113(18.3)

503(81.7)

12(3.9)

89(28.9)

207(67.2)

0.53

HC

306

98(16.0)

514(84.0)

12(3.9)

74(24.2)

220(71.9)

0.08

MTHFR

rs1801133

C

T

0.46

0.50

T

CC

CT

TT

2.14

0.34

MCI

304

354(58.2)

254(41.8)

98(32.2)

158(52.0)

48(15.8)

0.23

HC

311

374(60.1)

248(39.9)

100(32.2)

174(55.9)

37(11.9)

0.003

TMEM106B

rs1990622

C

T

0.001

0.98

T

CC

CT

TT

0.17

0.92

MCI

308

421(68.3)

195(31.7)

144(46.8)

133(43.2)

31(10.1)

0.97

HC

309

422(68.3)

196(31.7)

142(46.0)

138(44.7)

29(9.4)

0.58

MC1R

rs2228479

A

G

0.46

0.50

A

AA

AG

GG

2.92

0.23

MCI

307

141(23.0)

473(77.0)

20(6.5)

101(32.9)

186(60.6)

< 0.001

HC

309

132(21.4)

486(78.6)

14(4.5)

104(33.7)

191(61.8)

0.001

CENPO

rs6669072

C

T

0.03

0.86

T

CC

CT

TT

0.41

0.81

MCI

310

500(80.6)

120(19.4)

203(65.5)

94(30.3)

13(4.2)

0.61

HC

309

496(80.3)

122(19.7)

198(64.1)

100(32.4)

11(3.6)

0.71

PVRL2

rs6859

A

G

0.01

0.92

A

AA

AG

GG

1.49

0.47

MCI

310

195(31.5)

425(68.5)

30(9.7)

135(43.5)

145(46.8)

0.86

HC

309

196(31.7)

422(68.3)

24(7.8)

148(47.9)

137(44.3)

0.06

STARD6

rs10164112

C

T

5.30

0.02^b

T

CC

CT

TT

5.79

0.06

MCI

307

427(69.5)

187(30.5)

144(46.9)

139(45.3)

24(7.8)

0.23

HC

309

466(75.4)

152(24.6)

171(55.3)

124(40.1)

14(4.5)

0.15

APOE

rs7920721

A

G

0.72

0.40

G

AA

AG

GG

1.59

0.45

MCI

308

467(75.8)

149(24.2)

178(57.8)

111(36.0)

19(6.2)

0.76

HC

310

457(73.7)

163(26.3)

165(53.2)

127(41.0)

18(5.8)

0.32

APOE

rs429358

C

T

0.82

0.37

C

CC

CT

TT

2.92

0.23

MCI

294

50(8.5)

538(91.5)

3(1.0)

44(15.0)

247(84.0)

0.51

HC

294

59(10.0)

529(90.0)

1(0.3)

57(19.4)

236(80.3)

0.21

APOE

rs7412

C

T

0.01

0.93

T

CC

CT

TT

1.24

0.54

MCI

300

545(90.8)

55(9.2)

251(83.7)

43(14.3)

6(2.0)

0.02

HC

299

544(91.0)

54(9.0)

254(84.9)

36(12.0)

9(3.0)

< 0.001

KL

rs9536314

G

T

0.00

1.00

G

GT

TT

0.00

1.00

MCI

310

2(0.3)

618(99.7)

2(0.6)

308(99.4)

0.96

HC

310

2(0.3)

618(99.7)

2(0.6)

308(99.4)

0.96

BZRAP1-AS1

rs2632516

C

G

0.74

0.39

C

CC

CG

GG

1.03

0.60

MCI

307

274(44.6)

340(55.4)

55(17.9)

164(53.4)

88(28.7)

0.16

HC

308

290(47.1)

326(52.9)

65(21.1)

160(51.9)

83(26.9)

0.46

PFDN1/

HBEGF

rs11168036

G

T

0.48

0.49

T

GG

GT

TT

0.51

0.77

MCI

307

348(56.7)

266(43.3)

98(31.9)

152(49.5)

57(18.6)

0.89

HC

307

360(58.6)

254(41.4)

106(34.5)

148(48.2)

53(17.3)

0.91